Перед началом эксплуатации на дно компостера насыпают наполнитель для биотуалетов (толщина слоя должна быть не менее 5 см). После этого вводят органические отходы и добавляют биобактерии (их количество определяется согласно инструкции). Затем всё пересыпается слоем торфяного наполнителя из расчёта 1/3–1/2 к объёму отходов. Компостер заполняется до тех пор, пока уровень массы не достигнет нижнего вентиляционного канала. После этого регулирующий подачу воздуха вентиль устанавливают в положение 50 летом и 40 зимой. Далее компостер заполняют до верхнего вентиляционного канала, после чего производят регулировку вентиля в диапазоне 50–100 в зависимости от температуры окружающего воздуха. Начало процесса компостирования определяют по повышению температуры внутри массы (термометр следует закрепить под верхним вентиляционным каналом). Компостер продолжают наполнять до верхнего уровня.
Тепло, выделяющееся в процессе компостирования, не даёт массе замёрзнуть при понижении окружающей температуры. Однако в сильные морозы или при недостаточном объёме компостной массы она может замёрзнуть. Если температура в компостере установилась ниже 20 С, процесс заполнения не следует прекращать.
Компостер Biolan 550 устанавливают на твёрдый открытый грунт (для дренажа лишней влаги). Место выбирают таким образом, чтобы было исключено накопление стоячей воды. Если компостер устанавливается на плитку, то под дренажным отверстием её следует снять. При размещении системы в подсобном помещении отверстие оснащают дренажным шлангом, который выводят либо в канализацию, либо в накопительный резервуар.
Отходы созревают через 5–8 недель, при этом для того чтобы не замедлить процесс компостирования за один раз следует вынимать не более половины объёма.
После опорожнения компостера его не нужно мыть, так как микроорганизмы, участвующие в процессе компостирования, могут удалиться вместе с водой.